Čes-slov Pediat 2025, 80(5):226-230 | DOI: 10.55095/CSPediatrie2025/043
The use of artificial intelligence methods in pathology
- Ústav patologie a molekulární medicíny, Fakultní nemocnice v Motole, 2. lékařská fakulta Univerzity Karlovy, Praha
Současná patologie prochází zásadní proměnou. Z tradičního morfologického oboru se stává obor na pomezí klasické histopatologie, molekulární biologie a bioinformatiky. Rozvoj na poli výpočetní techniky a umělé
inteligence (AI) umožňuje zpracovávat nejen data, která generují molekulárně patologické analyzátory, ale i mikroskopické obrazy získané pomocí vysokokapacitních skenerů.
Digitalizované mikroskopické preparáty, tzv. whole slide images (WSI), je tak možné dále podrobovat algoritmickému zpracování pomocí celého spektra nástrojů strojového učení, mimo jiné také hlubokého učení založeného na umělých neuronových sítích. Právě nástroje založené na hlubokém učení otevřely nové možnosti v oblasti diagnostiky. Ukazuje se, že jsou schopné
detekovat nádory či metastázy v lymfatických uzlinách, rychle odhadovat jejich grade, a dokonce predikovat molekulárně patologické změny nádorových onemocnění.
Podobně jako v ostatních medicínských oborech ani v patologii není digitalizace bez svých úskalí. Výroba histologického preparátu je především ruční prací, a tak je nutné klást velký důraz na její kvalitu, na níž je pak
závislé správné fungování skenerů a následně i digitálně patologických nástrojů. Mimo tyto pro patologii specifické limitace narážíme i na překážky legislativní, ekonomické a technologické, jako je archivace a zpracování ohromných objemů dat v řádu stovek až tisíců terabytů ročně.
Digitální a výpočetní patologie představují dynamicky se vyvíjející diagnostický obor s výrazným dopadem na budoucnost nádorové diagnostiky a personalizované medicíny.
Modern pathology is currently undergoing a fundamental transformation. It is evolving from a purely morphological discipline to a
n integrated field that combines histopathology with molecular biology and bioinformatics. Rapid advances in computational technology and artificial
intelligence (AI) have enabled the processing of not only data generated by molecular pathology analyzers, but also of microscopic images, produced by high-capacity slide scanners.
These digitized microscopic slides, also known as whole slide images (WSI)
, can then be algorithmically processed using a wide range of machine learning tools, including deep learning, a subset of machine learning based on artificial neural networks. These deep learning-based approaches have opened new possibilities in diagnostics. They have demonstrated the ability to, among others, detect tumors and lymph node metastases, estimate tumor grade, and even
predict molecular alterations.
As in other disciplines of medicine, digitization in pathology is not without its challenges. The preparation of histological slides remains largely a manual process making it essential to maintain high-quality standards, as scanners and digital pathology tools rely heavily on clear, artefact-free slides to function properly
In addition to these pathology-specific limitations, broader economic, legal, and technical challenges must also be addressed, including the storage and analysis of massive volumes of data, which may reach hundreds or even thousands of terabytes annually.
Digital and computational pathology are rapidly advancing fields with profound implications for the future of cancer diagnostics and personalized medicine.
Keywords: digital pathology, computational pathology, artificial intelligence, deep learning
Accepted: September 3, 2025; Published: June 1, 2025 Show citation
References
- . OpenAI, Achiam J, Adler S, et al. GPT-4 Technical Report. 2024. doi: 10.48550/arXiv.2303.08774
Go to original source... - . Chen RJ, Ding T, Lu MY, et al. Towards a general-purpose foundation model for computational pathology. Nat Med 2024; 30(3): 850-862. doi: 10.1038/s41591-024-02857-3
Go to original source...
Go to PubMed... - . Unger M, Kather JN. Deep learning in cancer genomics and histopathology. Genome Med 2024; 16(1): 44. doi: 10.1186/s13073-024-01315-6
Go to original source...
Go to PubMed... - . Matthews GA, McGenity C, Bansal D, Treanor D. Public evidence on AI products for digital pathology. Npj Digit Med 2024; 7(1): 300. doi: 10.1038/s41746-024-01294-3
Go to original source...
Go to PubMed... - . Ertosun MG, Rubin DL. Automated grading of gliomas using deep learning in digital pathology images: a modular approach with ensemble of convolutional neural networks. AMIA Annu Symp Proc AMIA Symp 2015: 1899-1908.
- . Kather JN, Pearson AT, Halama N, et al. Deep learning can predict microsatellite instability directly from histology in gastrointestinal cancer. Nat Med 2019; 25(7): 1054-1056. doi: 10.1038/s41591-019-0462-y
Go to original source...
Go to PubMed... - . Fremond S, Andani S, Wolf JB, et al. Interpretable deep learning model to predict the molecular classification of endometrial cancer from haematoxylin and eosin-stained whole-slide images: a combined analysis of the PORTEC randomised trials and clinical cohorts. Lancet Digit Health 2023; 5(2): e71-e82. doi: 10.1016/S2589-7500(22)00210-2
Go to original source...
Go to PubMed... - . Jaber MI, Song B, Taylor C, et al. A deep learning image-based intrinsic molecular subtype classifier of breast tumors reveals tumor heterogeneitythat may affect survival. Breast Cancer Res 2020; 22(1): 12. doi: 10.1186/s13058-020-1248-3
Go to original source...
Go to PubMed... - . Fu Y, Jung AW, Torne RV, et al. Pan-cancer computational histopathology reveals mutations, tumor composition and prognosis. Nat Cancer 2020; 1(8): 800-810. doi: 10.1038/s43018-020-0085-8
Go to original source...
Go to PubMed... - . Vorontsov E, Bozkurt A, Casson A, et al. A foundation model for clinical-grade computational pathology and rare cancers detection. Nat Med 2024; 30(10): 2924-2935. doi: 10.1038/s41591-024-03141-0
Go to original source...
Go to PubMed... - . Oquab M, Darcet T, Moutakanni T, et al. DINOv2: Learning Robust Visual Features without Supervision. 2024. doi: 10.48550/arXiv.2304.07193
Go to original source... - . Touvron H, Martin L, Stone K, et al. Llama 2: open foundation and fine-tuned chat models. 2023. doi: 10.48550/arXiv.2307.09288
Go to original source... - . Lu MY, Chen B, Williamson DFK, et al. A multimodal generative AI copilot for human pathology. Nature 2024; 634(8033): 466-473. doi: 10.1038/s41586-024-07618-3
Go to original source...
Go to PubMed... - . PathChat Receives FDA Breakthrough Device Designation | Modella AI. Dostupné na: https: //www.modella.ai/pathchat-fda-breakthrough-designation
- . Zeng Y, Wei Z, Yu W, et al. Spatial transcriptomics prediction from histology jointly through Transformer and graph neural networks. Brief Bioinform 2022; 23(5): bbac297. doi: 10.1093/bib/bbac297
Go to original source...
Go to PubMed... - . McLendon R, Friedman A, Bigner D, et al. Comprehensive genomic characterization defines human glioblastoma genes and core pathways. Nature 2008; 455(7216): 1061-1068. doi: 10.1038/nature07385
Go to original source...
Go to PubMed...
This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0), which permits use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original publication is properly cited. No use, distribution or reproduction is permitted which does not comply with these terms.




